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SUMMARY:Defesa de Doutorado em Fisiopatologia Médica do aluno Wélliton de Souza
DESCRIPTION:TEMA: Desenvolvimento de sistemas escaláveis para pesquisa genômica em ambientes de computação de alto desempenho \nCandidato: Wélliton de Souza \nOrientadora: Iscia Teresinha Lopes Cendes \nData e Horário: 26/10/2020\, 13:30 hrs. \nLocal: Integralmente à distância no link https://meet.google.com/dpn-qybc-qhe \n  \nResumo\nTecnologias de sequenciamento de alto rendimento e a demanda crescente por análise de conjuntos de dados genômicos em larga escala criaram desafios computacionais e de reprodutibilidade. O grande volume de dados exige sistemas otimizados para execução em ambientes de alto desempenho e eficientes\, ao mesmo tempo em que os projetos de pesquisa expandem e novos recursos computacionais são adquiridos. Nesse contexto os protocolos de processamento tornaram-se mais complexos conforme técnicas de sequenciamento foram desenvolvidas para outras áreas além da genômica\, como transcriptômica e epigenômica. Esses protocolos são compostos de dezenas de tarefas que devem ser executadas em um fluxo de trabalho que pode ter ramificações e técnicas de paralelismo dificultando a publicação de pesquisas completamente reprodutíveis\, requisito cada vez mais presente na literatura. A reprodutibilidade também tem um papel importante em estudos de integração de diferentes ômicas. Dessa forma\, este trabalho apresenta ferramentas computacionais que\, quando combinadas a outros sistemas e padrões desenvolvidos pela comunidade\, criam um ecossistema para análise de dados de sequenciamento de larga escala\, reprodutível e suportado em ambientes computacionais heterogêneos. O ecossistema foi utilizado para analisar milhares de amostras de sequenciamento e possibilitou a execução de estudos em genômica\, transcriptômica e epigenômica. \n  \nBanca avaliadora\nTitulares \n\nIscia Teresinha Lopes Cendes – Presidente\nAndre Schwambach Vieira\nDiogo Fernando Troggian Veiga- Universidade Federal de Santa Catarina\nWilson Araújo da Silva Júnior- Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto\, Universidade de São Paulo\nMonica Barbosa De Melo\n\n  \nSuplentes \n\nEdi Lucia Sartorato\nKatlin Brauer Massirer\nMarcelo Ribeiro da Silva Briones\n\n 
URL:https://www.brainn.org.br/evento/defesa-de-doutorado-em-fisiopatologia-medica-do-aluno-welliton-de-souza/
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